兰州大学生态学研究所成立于2003年，是以生态学国家重点学科、生态学博士点和兰州大学干旱与草地生态教育部重点实验室为依托建立起的生态科学研究所和高层次人才培养基地。长期以来始终瞄准国际生态学的研究前沿和热点，针对国家生态安全与农牧业可持续发展的重大目标，以培养高层次生态学研究与教学3大领域进行了扎实的生态学实验及理论研究，取得了一系列研究成果。2006年因学科发展需要，经学校批准，生态学研究所分割为理论生态学、旱区农业生态和生态学三个研究所。

目前，生态学研究所人员：杜国祯（教授　博士生导师，所长），强维亚（副教授　硕士生导师），张世挺（副教授　硕士生导师），周显辉（实验员）。生态学研究所在青藏高原东部甘南州境内建有“高寒草甸生态系统野外研究定位站”，下设合作（海拔2900m）和玛曲（海拔3500m）两个长期定位观测点，拥有自动气象站，野外可控UV-B和二氧化碳植物生长室等大型科研仪器设备。

生态学研究所的主要研究内容为植物生态学，在青藏高原东部高寒草地进行理论及应用生态学定位研究。目前生态学研究所在读博士生和硕士生近50人。主要进行以下四个方向研究：

（1）群落物种多样性与生产力的关系,研究物种多样性与生物量,个体密度以及功能群间的关系;

（2）种子萌发生态学研究种子萌发特性与系统发育历史，以及种子大小和温度等生态学相关性;

（3）种子库研究高寒草甸种子库时空分布格局，以及种子库在退化草地恢复中的贡献与作用;

（4）植物繁殖生态学　以毛茛科和马先蒿属植物为模式植物研究植物繁殖分配和性分配、交配系统、个体大小变异和表型可塑性以及花多样性的进化机制;